欢迎使用新版太乙debug队列

为了更好地为超算用户服务，科学与工程计算中心工程师将debug做了一点小小的优化，并已经上线提供服务，欢迎各位使用。

debug队列的用处有哪些？

用处一：新用户熟悉超算
当我们申请了超算账号，开始阅科学工程计算中心网站上的太乙用户手册和FAQ，准备大展拳脚测试使用时候从哪里入手？

欢迎从使用debug队列开始熟悉太乙集群的节点配置和使用方法。
比如：bhosts hg_debug 命令可以查询debug队列的

1. 当前可用的节点名称（r13n44,r13n45…）
2. 当前运行状态等信息（STATUS列显示close说明被占据，ok说明该节点空闲）

xxxxxxxxxx
$ bhosts hg_debug
HOST_NAME          STATUS       JL/U    MAX  NJOBS    RUN  SSUSP  USUSP    RSV 
r13n44             ok              -     40      0      0      0      0      0
r13n45             closed          -     40     40     40      0      0      0
r13n46             ok              -     40      0      0      0      0      0
r13n47             closed          -     40     40     40      0      0      0
​

用处二：课堂教学活动
当同学们选了计算材料学,计算与编程等课程时，需要快速输出验证自己课堂练习的代码。
例如：
单节点单线程编译测试helloword

xxxxxxxxxx
#!/bin/sh                          
#BSUB -J 1node1core             ##job name
#BSUB -q debug                  ##queue name
#BSUB -n 1                      ##number of total cores 
#BSUB -R "span[ptile=1]"        ##cores per node
#BSUB -W 00:01                  ##walltime in hh:mm 
#BSUB -e %J.err.log             ##error log
#BSUB -o %J.output.log          ##output log
hostfile=`echo $LSB_DJOB_HOSTFILE`
NP=`cat $hostfile | wc -l`
cd $LS_SUBCWD
module purge
module load gcc/8.2.0
gfortran helloworld.f90 -o helloworld
./helloworld > $LSB_JOBID.log 2>&1

注意：计算资源申请量应该遵循最小化原则，此处我们只申请了1个核心和最大1分钟的运行时间，来编译和测试简单的代码。

用处三：测试不熟悉的任务
当你需要知道自己新编译的程序能否正常运行，欢迎使用debug队列来测试。
单节点并行测试：

xxxxxxxxxx
#!/bin/sh                          
#BSUB -J 1node2coers            ##job name
#BSUB -q debug                  ##queue name
#BSUB -n 2                      ##number of total cores 
#BSUB -R "span[ptile=2]"        ##cores per node
#BSUB -W 00:10                  ##walltime in hh:mm 
#BSUB -e %J.err.log             ##error log
#BSUB -o %J.output.log          ##output log
hostfile=`echo $LSB_DJOB_HOSTFILE`
NP=`cat $hostfile | wc -l`
module purge
module load intel/2018.4 mpi/intel/2018.4
mpirun -np $NP testprogram > $LSB_JOBID.log 2>&1

注意：按计算资源申请量最小化原则，此处我们只申请了2个核心和最长10分钟的运行时间。

跨节点并行测试：

xxxxxxxxxx
#!/bin/sh                          
#BSUB -J 2nodes2cores           ##job name
#BSUB -q debug                  ##queue name
#BSUB -n 4                      ##number of total cores 
#BSUB -R "span[ptile=2]"        ##40 cores per node
#BSUB -W 00:10                  ##walltime in hh:mm 
#BSUB -e %J.err.log             ##error log
#BSUB -o %J.output.log          ##output log
module purge
module load intel/2018.4 mpi/intel/2018.4
cat $LSB_DJOB_HOSTFILE|sort|uniq >hostlist
NP=2
export OMP_NUM_THREADS=2
mpiexec.hydra -machinefile hostlist -np $NP testprogram

注意：基于计算资源申请量最小化原则，此处我们只申请了2个节点，每个节点2核，上面的lsf脚本中设置了NP=2也可以测试两个节点，每个节点1个线程，每个线程用2个核的MPI/OPENMP混合并行编程任务（MPI OpenMP hybrid job）。export OMP_NUM_THREADS=2 限制了每个节点上的1个线程调用2个核计算。-machinefile hostlist 参数使任务平均分配到申请的节点上去运行。

debug队列的特点有哪些？

基于以上三个用途，太乙debug队列更新后特点如下：

特点一：增加至4个刀片节点，每个节点最大可用40核心，最大可同时提供160核

特点一：最长运行时间20分钟，快进快出，长时间任务请转隔壁short，medium，large队列

特点二：单个任务最多2个节点，用于测试跨节点任务

问答

Q: 发现debug队列有没有空余资源，等待时间超，该如何反馈？

A：可以将问题描述发邮件到hpc@sustech.edu.cn反馈，工程师收到邮件后会第一时间处理。

Q:其他队列使用率过高，我想在debug队列运行常规计算任务，能延长时间限制吗？

A：不能。debug队列更新的目的是方便用户快速测试和调试程序，常规计算任务请投递到其他队列

Q: 胖节点，gpu节点资源有测试节点吗？

A：没有。请将需求建议提交邮件发送到hpc@sustech.edu.cn，我们会根据后续用户反馈和需求，进一步制定计划，优化集群，提升服务质量。